首都醫科大學附屬北京朝陽醫院醫學研究中心（原基礎醫學研究中心）成立于1994年。2010年與北京市呼吸與肺循環重點實驗室整合，建立了首都醫科大學附屬北京朝陽醫院實驗研究中心暨國家重點學科呼吸病學實驗室。2013年，為了緊密配合重點學科建設和醫院發展規劃，我院大力引進海外高層次人才和優秀留學歸國人員來院工作，同時積極整合醫院內部科研資源，將基礎醫學研究中心、呼吸基礎及呼吸流行病學研究室合并，成立了首都醫科大學附屬北京朝陽醫院醫學研究中心，旨在建立一個以應用基礎研究為特色，具有國際影響力的科研平臺。

　　為推動我院多學科發展，通過整合北京朝陽醫院、北京呼吸疾病研究所的科研資源，醫學研究中心先后搭建了以呼吸疾病、心血管疾病等優勢學科為特色的高水平科研平臺，提升了我院科研條件，并推動科技成果轉化，與本市其他科研機構形成優勢互補的局面，全面服務于“北京市全國科技創新中心”的建設。自投入運行以來，為全院20多個科室的年輕醫生、研究生提供了實驗場所，每年度在室研究生超過 400 余人，成為我院各科室科學研究與研究生培養的基地。每年依托醫學研究中心開展科研課題超過 50 余項，發表論文 120 余篇。

　　隨著醫院的科研水平提升，為適應我院作為集醫療、教學、科研、預防為一體的大型綜合性三級甲等醫院的特點及“一院三址”的現狀，2023年，根據實驗室生物安全規范要求，結合醫院學科和研究平臺建設規劃，醫學研究中心對于三個院區的科研平臺重新進行了功能定位和職能劃分。其中，院本部醫學研究中心設置重點學科實驗室及臨床流行病學研究室，通過集中整合呼吸疾病、心血管疾病等優勢學科的研究力量，實現資源高效整合；石景山院區醫學研究中心主要負責為石景山院區臨床和基礎科研工作提供實驗平臺和科研服務的支撐和保障；常營院區以多學科交叉融合為建設方向，以實驗平臺搭建為載體，建立和開發實驗技術，服務醫院整體科學研究，與院本部及石景山院區醫學研究中心實現功能互補。

　　本部醫學研究中心是北京朝陽醫院成立的專門從事科學研究的部門，占地3600多平方米擁有完備的實驗平臺和儀器設備，目前包括5個PI 專用實驗室，以及公用實驗平臺，實驗平臺包括：細胞生物學，分子生物學、組織病理學、 細胞影像學、動物實驗平臺、生物樣本庫等。儀器設備包括：流式細胞儀，自動化組織病理染色儀，激光共聚焦顯微鏡、多色免疫組織成像系統工作站、超低溫冰箱等。規范生物標本庫與臨床信息資源庫，實現全院的轉化醫學研究的資源共享；建立轉基因動物飼養與研究平臺，為全院的基礎實驗研究提供便利條件；優化公共實驗平臺，為全院人員提供科研場所與服務；打造呼吸與肺循環專業化實驗室，為進一步提高國家呼吸病學重點學科的學術水平與學術影響力提供平臺，為申報國家重點實驗室打下良好的基礎并提供必要的硬件支撐條件。同時，醫學研究中心于2016年下設臨床流行病學研究室。作為醫學研究中心的二級科室，臨床流行病學研究室掛靠首都醫科大學臨床流行病學與臨床試驗學系，是“北京市臨床研究質量促進中心（北京朝陽醫院）”（簡稱質促中心）執行科室。科室自成立以來，積極搭建專業化臨床研究方法學平臺，為院內外醫療機構提供全方位臨床研究方法學技術支持與服務。

　　石景山院區臨床醫學研究室成立于2013年，實驗室于2018年9年初裝修完畢并投入使用后，目前擁有較完善臨床基礎研究實驗平臺，包括細胞實驗，分子生物學實驗，SPF級小鼠實驗，小動物呼吸功能，病原微生物宏基因組測序（NGS）分析等檢測平臺。目前實驗室工作人員3人，具有博士學位2人，承擔國家自然科學基金，北京市自然科學基金，北京市首都特色等基礎和臨床項目。目前主要職責包括為石景山院區臨床和基礎科研工作提供實驗平臺和科研服務的支撐和保障，包括：（1）為臨床科室的科研人員提供實驗場地、實驗儀器的同時研究室提供實驗技術培訓、臨床樣品登記保存服務，并以科研咨詢門診方式，為各臨床科室的科研人員提供科研思路、研究方案、基金申請等指導服務，2、組織學術活動推動院內臨床科研發展，形成良好科研氛圍；3.完成臨床急需的臨床檢測項目。

　　常營院區科研實驗平臺包括科研實驗室和生物樣本庫兩部分，擬建設 12 個實驗平臺，包括公共實驗平臺6個，PI 實驗室平臺5個，面積約2600平米；以及生物樣本庫平臺1個，面積約為600平米，均按照二級生物安全標準進行建設。公共實驗平臺包括：細胞生物學實驗平臺、分子生物學實驗平臺、組織病理學實驗平臺、蛋白生物結構與功能平臺、流式細胞實驗平臺、顯微鏡平臺；PI實驗室：用于各課題組開展科研活動，每個實驗室包括實驗區域和辦公區域，實驗區域用于開展實驗工作，辦公區域用于PI、研究生文獻閱讀、組織小型進展匯報會議、休息等；生物樣本庫將按 CNAS 標準建立，由專業團隊負責管理和運行，并為我院科 研提供服務。服務內容包括生物樣本和臨床信息的采集、樣本制備、保藏、分發、 銷毀、生物樣本質量控制等。還可根據課題組需求，提供相關技術服務。

　　目前，依托醫學研究中心的研究機構包括1個教育部重點實驗室、3個北京市重點實驗室、1個北京市工程中心和3個北京市國際科技合作基地：

　　1. 心血管疾病生物醫學工程教育部重點實驗室（2019）

　　2. 呼吸與肺循環北京市重點實驗室（2010）

　　3. 高血壓病研究北京市重點實驗室（2013）

　　4. 心肺腦復蘇北京市重點實驗室（2014）

　　5. 北京市呼吸與危重癥診治技術研究工程中心（2011）

　　6. 婦產科疾病免疫轉化研究北京市國際科技合作基地（2016）

　　7. 聲源定位測試及康復訓練北京市國際科技合作基地（2017）

　　8. 間質性肺疾病診療與研究北京市國際科技合作基地（2018）